В самом начале 6 сезона Декстер Морган идет на встречу выпускников средней школы в честь 20-летия со дня выпуска, чтобы найти там бывшего короля выпускного бала. Все идет отлично, пока он не сталкивается с ужасным убийством с явными религиозными мотивами. Дебра Морган в своих отношениях с Куином и будучи детективом, неожиданно становится героем.

Чтобы раскрыть загадочные и жуткие убийства, Декстер обращается за помощью к Брату Сэму, министру с криминальным прошлым. Дебра, которая теперь считается местным героем, удивлена двумя сделанными ей предложениями, которые способны изменить ее жизнь.

Декстер сталкивается с отрезвляющим представлением о своем возможном будущем, когда серийный убийца из его прошлого неожиданно предстает перед ним. Дебре становится некомфортно от ее новой работы. А Трэвис изо всех сил пытается сделать своего наставника счастливым, когда он и Геллар подготовили новую таблицу, гарантируя, что следующая задача Дебры будет гораздо сложнее.

Ситуация с Харрисоном заставляет Декстера, к его же собственному удивлению, обращаться за поддержкой к Брату Сэму. Но когда он сталкивается с очередным жутким перечнем Геллара и Тревиса, он вынужден задать вопрос, становится ли вера смертельной в не тех руках. Имея на руках доказательства религиозных мотивов убийцы, Декстер начинает охоту на этого фанатика, Дебра тем временем участвует в своей первой официальной пресс-конференции.

С помощью своего нового друга Брата Сема, Декстер борется с тьмой в своей душе, в то время как поиск убийцы принимает новое направление. Батиста и Куинн наносят визит в университет, в котором преподавал Профессор Геллар.

Декстер оказывается втянутым в очень личное дело, которое побуждает его прибегнуть к помощи его «Темного пассажира». Между тем Дебра чувствует себя заваленной ее новыми лейтенантскими обязанностями. Ситуация осложняется еще сильнее, когда она узнает, что Куинн изменяет ей со свидетельницей по делу «Судный день».

Во время поездки в штат Небраска, чтобы подчистить некоторые хвосты из прошлого, Декстер воссоединяется со своим «Темным Пассажиром». Дебра продолжает расследовать убийства из дела «Страшный суд», но, став лейтенантом, у нее появляются некоторые сложности.

Чтобы проанализировать новые зацепки по Судному дню, Декстер использует знания, полученные от тех уроков, которые преподал ему Брат Сэм.

Декстер находит неожиданное решение, чтобы оставаться всегда на шаг впереди отдела по расследованию убийств. Дебра продолжает наблюдаться у терапевта и узнает о себе нечто новое.

Декстер пытается разгадать, кто станет следующей жертвой убийц Судного дня, чтобы предотвратить новое преступление. Дебра находится под сильным впечатлением от места преступления и приходит к осознанию того, что она слишком сильно полагается на брата.

Декстер полагает, что для того. Что поймать Убийц Судного дня, он должен следовать по их стопам и самостоятельно воссоздавать жуткие сцены. Противостояние Дебры с Лагерта по делу мертвой девушки по вызову выходит из-под контроля. Терапевт Дебры делать предположение, которое расстраивает ее.

Декстер и Убойный отдел пытаются схватить убийц Судного дня до наступления лунного затмения, пока не свершился их ужасный акт.